El marco epistemológico de la Naturopatía es el conocimiento que se genera, a partir del desarrollo del propio núcleo disciplinar de la Naturopatía, en respuesta a las necesidades de la práctica profesional Naturopática.

Las formas de acercarse a la realidad, es decir las formas de conocer propias de la Naturopatía, se explican por:

1. La ciencia Naturopática, expresada en la teoría científica, los modelos para la práctica profesional, la explicación, predicción de hechos y evaluación del proceso.

2. La filosofía de la Naturopatía articulada en torno al sistema de creencias y valores de la profesión Naturopática, a una constante búsqueda de conocimientos, a una determinada forma de pensar sobre los fenómenos; constituyendo todo ello un elemento de fundamental importancia para la práctica profesional Naturopática.

3. La ética, moral y deontología de la Naturopatía, especificada por expresiones de modelos éticos, códigos, normatividades y estándares.

4. El conocimiento personal del Profesional Naturópata, plasmado en la experiencia y en los valores y creencias personales

5. La estética o el arte de la Naturopatía, manifestado por la plasticidad de la praxis profesional Naturopática, es decir patrones de conocimiento de la Naturopatía.

6. El compromiso vital y social del profesional Naturópata, expresado en su decidida vocación de servicio con eficacia, eficiencia y excelencia; y por su continuo mejoramiento en la calidad del Servicio Profesional de Naturopatía.

La razón de ser de la Naturopatía es la práctica profesional e, idealmente, todo conocimiento de Naturopatía tiene que tener objetivo el solucionar los problemas de la práctica profesional Naturopática