La Organización Colegial Naturopática impulsa la investigación en Naturopatía como eje central de la práctica profesional Naturopática, para ello tiene establecido, entre otros elementos de apoyo a la investigación Naturopática, entre ellos las Jornada de Investigación en Naturopatía que tienen como objetivo general familiarizar a los profesionales de la Naturopatía en la metodología y técnicas de investigación en la profesión Naturopática, así como facilitar un espacio de encuentro entre profesionales Naturópatas y profesionales del campo científico en general para lograr así la formación de grupos de investigación competitivos, incorporar a nuevos profesionales de Naturopatía a grupos de investigación existentes y lograr la formación de nuevos grupos de investigación facilitando el contacto entre profesionales.

Una vez que la Naturopatía va desarrollándose como ciencia se va ampliando su campo de actuación, ya no se limita al campo exclusivamente de la relación persona-naturaleza (en un sentido puramente fisicalista) sino que va ampliando su acción hacia problemas sociales (sociología de la salud), culturales e interpersonales del comportamiento humano (psicología de la salud).

Así pues, si los Profesionales Naturópatas Colegiados queremos vernos como profesionales de salud independientes, el confiar sólo en marcos conceptuales de otras disciplinas implica una falta de autogobierno, de autodirección, y en última instancia de autonomía profesional.

Para que los Profesionales Naturópatas Colegiados sigamos ofreciendo un servicio singular y de carácter autónomo, dentro del marco de las Ciencias de la Salud, a la sociedad, y para ello tenemos nuestro marco conceptual claro, explícito y específico de la Naturopatía.

En los últimos años, los dos aspectos en que la Naturopatía contemporánea está centrada en profundizar son:

• la autonomía profesional (la Naturopatía es una disciplina de carácter autónomo dentro del marco de las Ciencias de la Salud), 
• la identificación (La Naturopatía no es una método alternativo ni una terapia natural es una disciplina científica) y 
• profundización en el cuerpo de conocimientos propios de la Naturopatía, rompiendo con la tradicional dependencia del modelo médico – terapéutico.

La calidad de de los Servicios Profesionales de Naturopatía va mejorando a medida que la responsabilidad científica se convierta en parte integrante de la práctica profesional Naturopática, al igual que sus tradiciones filosóficas y humanistas; la responsabilidad científica es indispensable para el Profesional Naturópata Colegiado.