La Ciencia Naturopática ha tenido un desarrollo significativo desde los inicios del siglo XX, lo cual se evidencia en el desarrollo de modelos conceptuales y teorías Naturopáticas, consecuencia todo ello de la actividad investigadora.
La Naturopatía desde sus orígenes era considerada como una actividad basada en el experiencia práctica y el conocimiento común, y no contemplaba el conocimiento científico de la profesión, este nace con el primer modelo de Naturopatía elaborado por Benedict Lust (1901). El desarrollo de la Naturopatía como disciplina profesional es muy reciente ya que elabora su propio cuerpo de conocimientos a partir de las investigaciones de Benedict Lust que establece los fundamentos de nuestra actividad Naturopática realizando los primeros trabajos que marcan nuestros orígenes como profesión y forman el núcleo a partir del cual se desarrolla la Ciencia Naturopática.
En comparación con otras ciencias en desarrollo, la Naturopatía todavía esta en la fase de sistematización. Hasta los años 60 del siglo XX era poco frecuente la utilización del término ciencia Naturopática; este surge a partir de considerarse que la base del conocimiento para el ejercicio de la Naturopatía es inadecuada e incompleta, y que el desarrollo de una base científica para dicho ejercicio tiene una gran prioridad para la disciplina, la teoría forma parte del desarrollo del profesional Naturópata en cuanto a formación y ejercicio profesional.
Desde la promulgación del Criterio Naturopática por Juan Esteve Dulin en 1958, el desarrollo de la Naturopatía como disciplina ha sido innegable, y esto se debe fundamentalmente al interés por el desarrollo del conocimiento y la investigación.
La Naturopatía ha desarrollado modelos conceptuales que la definen como disciplina de carácter autónomo dentro del marco de las Ciencias de la Salud, y explican su razón de ser, sus principios científicos y filosóficos, y sus valores.
Estos avances tan significativos en la identidad científica y profesional de la Naturopatía, no se ha plasmado, todavía, por igual en los diferentes escenarios de la práctica. Algunos de los factores que han influido en esta situación son, que muchos Naturópatas continúan fundamentando su práctica en el modelo médico, lo cual les dificulta profundizar sobre aspectos que son de especial interés para el desarrollo del conocimiento Naturopático, generar teorías e indicadores de calidad.