A finales del siglo XIX, la Naturopatía inició un largo proceso para conseguir su reconocimiento como disciplina científica y profesión dentro del marco de las Ciencias de la Salud. En este periplo precisó ir elaborando una fundamentación epistemológica desde la que justificar su presencia social, su estatus científico y realidad profesional.

La identidad diferenciadora de la Naturopatía requiere seguir en la construcción de un fundamento epistemológico que oriente tanto su cuerpo doctrinal como su aparato metodológico.

No hay pensamiento profundo ni acción racional totalmente desvinculados de toda filosofía Especificamente, el razonamiento Naturopático y el ejercicio de la Naturopatía están y han estado siempre impregnados de ideas filosóficas , a veces inspiradoras, otras inhibitorias.

El contenido del modelo conceptual de la Naturopatía se nuclea en torno a:

• Concepto integrativo de la salud
• Participación activa de la persona en el proceso de salud
• Concepto multifactorial de la salud
• Estudio sistemático de las relaciones entre los factores transpersonales, sociales, ecológicos, psicológicos y biológicos que determinan la distancia entre un nivel optimo de salud y la perdida de salud a la vez que explican la historia natural de la mayoría de los proceso de salud (nivel optimo de salud / perdida de salud)
• Utilización de Métodos Naturales y Tradicionales de Salud o Agentes Naturales de Salud para la autogestión de la salud (en el plano individual) y cultura de la salud (en el plano social).

Los límites de la Naturopatía no está en las tecnologías Naturopáticas sino en los modelos conceptuales. Y la nueva definición conceptual es tarea de todos.