Aggarwala, V., Liang, G., & Bushman, F. D. (2017). Viral communities of the human gut: metagenomic analysis of composition and dynamics. Mobile DNA, 8(1), 12.

ANTECEDENTES: Las entidades biológicas numéricamente más abundantes en la Tierra son los virus. Grandes poblaciones se aprovechan de la microbiota celular en todos los hábitats, incluido el intestino humano.

CUERPO PRINCIPAL: Aquí revisamos los enfoques para estudiar el viroma humano y algunos resultados recientes sobre el movimiento de secuencias virales entre células bacterianas y huéspedes eucariotas. Primero presentamos una visión general de los métodos bioquímicos y bioinformáticos, enfatizando que las elecciones específicas en los métodos utilizados pueden tener fuertes efectos en los resultados obtenidos. Luego revisamos los estudios que caracterizan el viroma del intestino humano sano, que revelan que la mayoría de los virus detectados son típicamente fagos no caracterizados, la materia oscura viral, y que los virus que infectan las células humanas se encuentran muy raramente. Luego revisamos el movimiento del fago entre las células bacterianas durante el tratamiento con antibióticos. Aquí, una propuesta radical para el movimiento extensivo de genes antibióticos en fagos ha sido cuestionada por un cuidadoso reanálisis de los métodos de anotación metagenómica utilizados.

CONCLUSIÓN BREVE: Los métodos para estudiar el viroma intestinal humano están mejorando, produciendo datos interesantes sobre el movimiento de los genes del fago entre las células y los organismos hospedadores de mamíferos. Sin embargo, las poblaciones virales son vastas y los estudios de su composición y función apenas comienzan.