Vemuri, R., Shankar, E. M., Chieppa, M., Eri, R., & Kavanagh, K. (2020). Beyond Just Bacteria: Functional Biomes in the Gut Ecosystem Including Virome, Mycobiome, Archaeome and Helminths. Microorganisms, 8(4), 483.

La microbiota intestinal se refiere a una red compleja de microbios, que ejerce una marcada influencia en la salud del huésped. Se compone de bacterias, hongos, virus y helmintos. Las bacterias, o colectivamente, el bacterioma, comprenden una proporción significativa del microbioma bien caracterizado. Sin embargo, las otras comunidades conocidas como ‘materia oscura’ de microbiomas como virus (viroma), hongos (micobioma), arqueas (arqueo) y helmintos no se han dilucidado por completo.

El desarrollo de métodos de metagenómica nuevos y mejorados ha permitido la identificación de genomas completos del material genético en el intestino humano, abriendo nuevas perspectivas sobre la comprensión de la composición del microbioma intestinal, su importancia y posibles aplicaciones clínicas.

Aquí, revisamos la evidencia reciente sobre los virus, hongos, arqueas, y helmintos encontrados en el intestino de los mamíferos, que detallan sus interacciones con la microbiota bacteriana residente y el huésped, para explorar el impacto potencial del microbioma en la salud del huésped. También se discute el papel de los trasplantes de viroma fecal, las intervenciones previas, pro y simbióticas en la modulación del microbioma y sus preocupaciones relacionadas.