Minot, S., Sinha, R., Chen, J., Li, H., Keilbaugh, S. A., Wu, G. D., … & Bushman, F. D. (2011). The human gut virome: inter-individual variation and dynamic response to diet. Genome research, 21(10), 1616-1625.

CONTEXTO: Inmensas poblaciones de virus están presentes en el intestino humano y otros sitios del cuerpo. La comprensión del papel de estas poblaciones (el “viroma” humano) en la salud y la enfermedad requiere una comprensión mucho más profunda de su composición y dinámica frente a la perturbación ambiental. 

OBJETIVO: Aquí, investigamos viromas de sujetos humanos en un régimen de alimentación controlada. 

MÉTODO: Las muestras fecales longitudinales se analizaron mediante secuenciación metagenómica de ADN de partículas similares a virus (VLP) y comunidades microbianas totales. 

RESULTADOS: El ensamblaje de 336 Mb de secuencia VLP produjo 7175 contigs, muchos identificables como genomas de bacteriófagos completos o parciales. Los contigs eran ricos en funciones virales requeridas en el crecimiento lítico y lisogénico, así como en funciones inesperadas, como las matrices CRISPR virales y los genes para la resistencia a los antibióticos. La mayor fuente de variación entre las muestras de viroma fue la variación interpersonal. El análisis de secuenciación profunda paralela de poblaciones bacterianas mostró la covaración del viroma con el microbioma más grande. La intervención dietética se asoció con un cambio en la comunidad viromica a un nuevo estado, en el que convergieron los individuos con la misma dieta. 

CONCLUSIÓN: Por lo tanto, estos datos proporcionan una visión general de la composición del viroma intestinal humano y asocian la estructura del viroma con la dieta.